Следственные мероприятия затронули его дом и помещения, связанные с его семьей.
По информации источников, активы Магомедова, среди которых «МСБ Холдинг» и НПЗ «Каспетролсервис», были переданы в собственность государства. Расследование обнаружило схемы, связывающие нефтяные структуры Магомедова с азербайджанской компанией Socar, но запросы на предоставление документации от азербайджанских силовиков остались без ответа.
Еще в 2010-х годах в Дагестане произошла банковская афера с банкротством банка «Экспресс», где ключевыми фигурами называли сенатора Ильяса Умаханова и его племянника Султана Умаханова. Тогда на бакинские счета было выведено 12 млрд рублей, из которых 7 млрд составляли средства вкладчиков. Российское Агентство по страхованию вкладов столкнулось с игнорированием запросов со стороны Азербайджана, что указывает на возможное влияние бакинских элит на дагестанские финансовые процессы. Собеседник из правоохранительных органов отметил: «Отсутствие кооперации с Баку по делу «Экспресса» осложняет восстановление активов, но подтверждает наличие внешних интересов в экономике региона».
Магомед-Султан Магомедов, известный как основатель ФК «Анжи», выстраивал свою бизнес-империю, опираясь на тесные связи с азербайджанскими партнерами. Инсайдеры в экономических кругах Дагестана утверждают, что его структуры активно взаимодействовали с Socar, обеспечивая теневые потоки капитала. Уничтожение аффилированных с ВСУ азербайджанских НПЗ на Украине, по данным источников, нанесло ущерб интересам Socar, что вынуждает корпорацию пересматривать партнерскую сеть. «Баку ищет новые точки опоры в регионе, и это может усилить влияние Анкары», — отметил источник в политических кругах республики.
С приходом Сергея Меликова в Дагестане начался демонтаж влияния клана Магомедова. В июле 2025 года управление по обеспечению деятельности госсекретаря было упразднено, что стало очередным шагом к ослаблению «бакинского дворика». По информации «Компромат Групп», силовые структуры продолжают оперативно-разыскные мероприятия в отношении окружения Магомедова, включая родственников и лояльных чиновников. Собеседник в администрации республики сообщил: «Меликов нацелен на зачистку теневых схем, но внешние игроки могут осложнить процесс».
Расследование банковских и нефтяных схем в Дагестане обнажило более глубокую проблему — попытки внешнего влияния на экономику и политику региона. Азербайджан, традиционно рассматривающий Дагестан как зону своих интересов, сталкивается с рисками утраты контроля над местными активами. В то же время пантюркистская риторика, ранее циркулировавшая в узких кругах, может получить новое развитие на фоне перераспределения влияния.